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Espèce 1 | Total | |||
Présente | Absente | |||
Espèce 2 | Présente | a | b |
a + b |
Absente | c | d | c + d | |
Total |
a + c |
b + d |
a + b + c + d |
Dans
ce tableau, N = ( a + b + c + d )
Il y a N1 = (a + c) relevés avec l'espèce 1.
Il y a N2 = (a + b) relevés avec l'espèce 2.
Les
espèces 1 et 2 sont simultanément présentes dans a
On ne trouve ni l'une ni l'autre dans d relevés (co-absence, qui est écolgiquement non significative).
A priori, plusieurs méthodes de calcul d'indices sont envisageables.
L'indice
de JACARD représente le nombre de cas de présence simultanée des
deux espèces considérées, divisé par le nombre de cas où au moins l'une
des deux est présente:
IJacard = a / (a + b + c).
Certains
auteurs utilisent aussi l'indice de SORENSEN , assez similaire au
précédent, mais qui pondère par 2 le terme de co-occurence (a).
Isorensen = 2a / (2a + b + c).
L'indice
de SOKAL et MICHENER représente le nombre de présences ou
d'absences simultanées divisé par le nombre total de relevés:
ISokal = (a + d ) / (a + b + c + d).
Le
coefficient de CORRELATION linéaire s'obtient ² la relation:
R = (ad - bc) /
(a + b)(c + d)(a + c)(b + d)
Le terme (ad - bc) représente ici la différence du produit des présences
et absences simultannées moins le produit des présences d'une seule
espèce à la fois.
Remarquons
que la première méthode (Jacard) ne fait intervenir que les relevés dans
lesquels au moins une des espèces est présente, à la différence des deux
suivantes qui utilisent l'information contenue dans tous les relevés.
Cependant, il nous semble préférable de ne pas interpréter les cas d'absence
simultanée, non significatifs. C'est pourquoi le procédé de Jaccard à
été retenu pour calculer la similarité des districts et des espèces.
Cet histogramme de distribution des valeurs d'originalité de l'avifaune des
sites du Vercors montre que les sites dont l'originalité avifaunistique
cumulée dépasse 26 se font rares.
(Rappelons que les coefficients sont ici tous multipliés par 1000).
Dans le Vercors, l'originalité des sites est associée à des altitudes
élevées.
Avec une échelle d'analyse passant du site au district entier, on observe
une distribution des cumuls d'originalité par région assez similaire au cas
des sites d'écoute ponctuels du Vercors, avec une distribution assymétrique.
Etant donné que le nombre d'espèces passe de 15 à 100 environ, le cumul est
évidemment plus élevé.
Un district se démarque très nettement, les Dombes, avec l'
originalité avifaunistique la plus élevée.
Même en prenant en compte l'augmentation du nombre d'espèces qui fait croître l'originalité du district, certains d'entre eux se détachent par leur originalité supérieure à ce que leur seul nombre d'espèces lasserait prévoir.
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